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基因敲入细胞

基因定点敲入(KI,gene knock in)技术是指在细胞基因组特定位点精准敲入外源基因序列,使其在细胞内稳定表达的一种基因编辑技术。

技术原理:
DNA双链断裂(DSB)是基因敲入的关键步骤,这一损伤会触发细胞中的两种DNA修复机制:非同源末端连接(NHEJ)和同源定向修复(HDR)。基因敲入技术的核心是gRNA或crRNA引导Cas酶切割目标位点的DNA双链,细胞利用外源提供的Donor为模板,基于HDR或NHEJ机制将目标基因序列精确地敲入到基因组的特定位置。

基因敲入基本技术原理-球盟会生物基因
基因敲入基本技术原理
球盟会生物基因积攒十几年的基因编辑经验,建立4种基因敲入技术,包括:HES-KI、CRISPaint、Bingo™和CRISPR/HDR,满足各种基因敲入需求,实现效率与精准度的双重突破,为您扫平基因敲入细胞构建的障碍。
技术类型 效率 优点 适用场景
CRISPR/HDR 5-30% 灵活性高,支持点突变和片段插入 分裂较活跃细胞
CRISPaint 20-50% 不依赖细胞周期 分裂周期长的细胞
Bingo™ 30-80% 无DSB或供体模板,脱靶风险低 精准敲入小片段或点突变修复
HES-KI 40%-90% 独特筛选机制介导高效敲入 重要基因位点C端敲入

应用范围
● 工业生产:目的基因表达高稳定性和均一性,保障了产品大规模生产的产量和质量。
● 基因治疗:确保细胞治疗中治疗性基因的稳定整合。
● 干细胞工程:在IPSC中实现了高效率的转基因敲入。
● 功能基因组学:筛选必需基因的功能域或调控元件。
● 疾病建模:构建符合生理表达水平的基因修饰细胞系。

服务详情

细胞类型 肿瘤细胞、干细胞等各类细胞,点击查看全部细胞系列表
服务类型 荧光蛋白定点敲入(EFGP、Luc、mCherry等)/ 标签蛋白定点敲入(Flag、HA、Myc、HiBiT等)/ 特定位点敲入 / 基因点突变
交付标准 基因敲入单克隆细胞1株(2管细胞,1×10^6/管)
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HES-KI技术

HES-KI技术原理

HES-KI(重要基因位点敲入)是一种新型的敲入技术,顺利获得在重要基因的C端外显子区域进行CRISPR编辑,并设计一个转基因敲入模板,使得成功敲入的细胞能够恢复重要基因的功能,同时整合敲入的基因序列;如果未成功敲入细胞,如NHEJ介导的有插入或缺失(indels)的细胞,将导致重要基因功能丧失,使细胞无法存活,从而实现对成功敲入细胞的富集。

HES-KI技术优势

高效率
顺利获得正向选择机制,避免非特异性敲入,提高敲入效率,在多种细胞类型中实现高达68%的敲入效率,远超传统技术
稳定且均一
敲入单克隆细胞中目的基因表达稳定且均一
多基因整合
可同时敲入多个基因,例如,敲入多个CAR基因,全面靶向多种肿瘤抗原,减少肿瘤逃逸
调控能力强
顺利获得选择不同的重要基因,可灵活调整目的基因表达水平

HES-KI成功案例

案例一  AsCas12介导的HES-KI
目的:K562细胞GAPDH基因C端插入EGFP
设计:

结果:
• 使用HES-KI技术在K562细胞GAPDH中敲入EGFP,未使用抗性筛选情况下多克隆的敲入效率达到37%

• K562 EGFP-KI细胞和WT细胞单克隆细胞株倍增时间差异不显著,EGFP插入后不影响K562细胞生长。
• 不同K562 EGFP-KI单克隆细胞株EGFP mRNA表达量差异不显著,EGFP-KI单克隆均一性好。
• K562 EGFP-KI单克隆细胞株经过15代陆续在传代培养,EGFP mRNA表达量稳定。

• K562 EGFP-KI细胞图片
K562 EGFP-KI 多克隆
K562 EGFP-KI 单克隆
案例二  Cas9介导的HES-KI
目的:293T和CHO-K1细胞GAPDH基因C端插入EGFP
设计:

结果:
•  使用HES-KI技术,293T多克隆细胞中,EGFP的敲入效率达到68%。在CHO-K1多克隆细胞中,EGFP的敲入效率达到55%。


• 293T和CHO-K1 EGFP-KI多克隆细胞图片
293T CHO-K1
 
 

CRISPaint基因敲入

CRISPaint技术原理

CRISPaint是一种基于CRISPR-Cas9系统的基因敲入技术,顺利获得利用细胞自身的非同源末端连接(NHEJ)修复机制,能够在指定的基因C端位置敲入外源DNA片段,无需依赖同源重组(HDR)。CRISPaint的设计具有高度的灵活性,适用于多种基因功能研究和基因组编辑应用。

1、CRISPR-Cas9引导的双链断裂(DSB)
Target sgRNA质粒:切割基因特定位置,导致DNA双链断裂,激活细胞的DNA修复机制。


2、通用Donor载体设计
CRISPaint使用一种通用的供体DNA模板,顺利获得以下组分实现CRISPaint系统灵活的敲入策略:
Frame sgRNA质粒:切割Donor质粒,在细胞内形成线性化模版;有3种Frame-sgRNA可供选择,保证敲入基因正确OFR序列表达。
通用Donor质粒:包含待插入的基因序列(如荧光蛋白)和3种Donor-sgRNA的靶点序列。

3、非同源末端连接(NHEJ)
靶点基因形成DSB和Donor被切割,细胞顺利获得NHEJ修复机制,将线性化的Donor模版整合至DSB位置,实现了高效的基因敲入。

CRISPaint技术优势

高效性
NHEJ介导基因敲入,无需同源臂,插入效率高达50%
适用范围广
不依赖于细胞分裂,适用于多种细胞类型
灵活性
通用Donor质粒包含3种Donor-sgRNA靶点序列,灵活选择Frame sgRNA质粒,实现基因ORF序列正确整合

CRISPaint实验流程

CRISPaint成功案例

案例一
目的:hESC H9细胞A基因C端敲入Neo抗性
设计:Donor质粒设计




实验设计


结果:
• Sanger测序验证Neo精确敲入至H9细胞A基因C端

 

Bingo™介导基因敲入

Bingo™技术原理

Bingo™ 是一种基于Prime Editing介导小片段敲入的基因编辑技术,能够在不依赖DNA双链断裂的情况下,实现对目标基因的精准编辑。该技术的核心在于使用融合了逆转录酶的Cas9 nickase(Cas9n-RT),在pegRNA引导下识别编辑位点,顺利获得Cas9n在编辑位点产生单链切口,逆转录酶利用pegRNA的模板序列在单链切口位置合成新的DNA序列,从而实现精准的基因敲入。

 

Bingo™技术优势

更安全
PE技术顺利获得单链切割实现编辑,避免了DSB带来的不稳定性,显著提高了编辑的安全性
高精确性
pegRNA携带的编辑信息确保了敲入片段的准确性,减少了脱靶和非预期编辑
多功能性
能够实现小片段DNA的插入(如终止密码子、标签序列等),适用于多种基因组编辑需求

Bingo™实验流程

 

 

Bingo™应用案例

案例一
HCT116细胞EGFR基因敲入(c.2319_2320 ins CAC)细胞株构建

项目信息
细胞名称 HCT116
基因 EGFR(Gene ID: 1956)
突变位点 c.2319_2320 ins CAC
Bingo™PE系统质粒设计
SpacerGCCCAGCAGGCGGCACACGTG
Bingo™ pegRNA Spacer GCCCAGCAGGCGGCACACGTG
Extension GTGGACAACCCCCACcacGTGTGCCGC
Bingo™ gRNA GCACcacGTGTGCCGCCTGCT


编辑效率检测
• HCT116细胞EGFR基因敲入(c.2319_2320 ins CAC)多克隆细胞测序结果


• HCT116细胞EGFR基因敲入多克隆细胞编辑效率为38%

 

CRISPR/HDR基因敲入

CRISPR/HDR技术原理

CRISPR/HDR是一种依靠CRISPR系统和细胞HDR修复机制实现基因敲入的基因编辑技术。sgRNA识别并结合目标基因位点,在Cas9核酸酶的作用下切割DNA双链,含同源臂的DNA供体模板在细胞HDR修复机制的作用下,整合至sgRNA切割位点中,实现精确的基因敲入。

 

CRISPR/HDR技术优势

 

灵活性高
可顺利获得调整sgRNA和Donor模板,在不同位置实现对外源基因序列的敲入
精准度高
pegRNA携带的编辑信息确保了敲入片段的准确性,减少了脱靶和非预期编辑

CRISPR/HDR技术流程

Advantage and Characteristic

Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
Optimazied Strategy
We have create a unique sgRNA Design Logic
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参考文献

Modulation of cell cycle increases CRISPR-mediated homology-directed DNA repair

该研究探讨了顺利获得同步细胞周期来增强CRISPR介导的同源重组修复(HDR)效率的方法。使用小分子调节细胞周期,在各种细胞系中实现了1.2-1.5倍的KI效率提高。研究还展示了该方法在动物胚胎中的应用,显著提高了猪胚胎中的KI频率。这一方法顺利获得调节细胞进入有利于HDR的周期阶段,从而提高了基因敲入的成功率,为CRISPR基因编辑提供了新的优化策略。

CLASH enables large-scale parallel knock-in for cell engineering

CLASH(Cas9-Linked Adaptor Synthesis for Homology-directed repair)技术能够在大规模细胞工程中实现高效的基因敲入。该方法结合了Cas9蛋白和适配子合成,使得在多种细胞类型中进行平行敲入成为可能。顺利获得在DNA修复过程中提供特定的适配子来提高同源重组修复(HDR)的效率,从而大大提升基因敲入的成功率。该技术展示了在细胞工程和基因编辑中的巨大潜力,特别是在需要多基因修改的复杂生物工程应用中。

FAQ

基因敲入在药物开发中的作用是什么?
基因敲入在药物开发中发挥了重要作用。它用于靶点验证,顺利获得将特定基因敲入细胞系或动物模型中,确认药物靶点的有效性。它还能帮助建立疾病模型,测试药物在这些模型上的疗效和安全性。基因敲入技术还支持药物筛选,顺利获得带有敲入基因的细胞系进行高通量筛选,发现潜在药物候选分子。此外,它还能揭示药物的作用机制,优化药物结构和用法。整体而言,基因敲入技术加速了药物研发过程,并提高了治疗效果和安全性。
基因敲入技术是顺利获得将外源基因序列插入到基因组的特定位置来实现基因功能研究或疾病治疗。球盟会生物基因利用先进的基因编辑工具,如CRISPR/Cas9系统,顺利获得引导核酸酶切割目标DNA,并利用同源重组或非同源末端连接将外源基因准确插入指定位置,以实现高效且精确的基因敲入。
球盟会生物基因在基因敲入技术中的主要优势包括:
效果保障:我们拥有10年CRISPR基因编辑经验,全球知名院校博士专家团队一对一服务。
高精度:利用球盟会生物基因开发的优化工具,减少脱靶效应,提高编辑的准确性。
高效率:球盟会生物基因的技术平台提高了基因敲入的成功率,加快了实验进程。
定制服务:根据客户需求,提供个性化的基因敲入解决方案,以满足不同研究或治疗目标。
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